1x20 - Fra cinque anni

L'episodio riprende cinque anni avanti nel futuro. L'Hiro del futuro racconta ad Hiro e Ando che cinque anni prima Sylar è esploso nel cuore della città, cambiando il mondo per sempre. Dice anche che sta studiando la linea del tempo per determinare il momento esatto in cui tornare indietro nel tempo per cambiare il futuro: il momento è il 4 ottobre, quando Hiro ha incontrato Peter nella metropolitana dicendo di salvare Claire per salvare il mondo; L'Hiro del futuro dice poi a Hiro di tornare indietro nel tempo, al giorno dell'esplosione della bomba, in cui dovrà uccidere Sylar, il giorno dopo le elezioni. L'Hiro del futuro dice che lo aveva accoltellato, ma Sylar aveva ucciso Claire e quindi, assorbendo il suo potere, si era rigenerato; ma ora che Peter l'ha salvata, Hiro riuscirebbe ad ucciderlo. Ad un certo punto però entra l'FBI, guidato da Matt e dall'haitiano, che cattura Hiro considerandolo un terrorista; L'Hiro del futuro racconta ad Ando il motivo di tutto ciò: quando Sylar esplose, tutto il mondo diventò tetro, ed è per questo che devono tornare indietro; ma l'haitiano riesce a bloccare i suoi poteri e quindi hanno bisogno di Peter, e così vanno a Las Vegas. A Las Vegas, in un locale, incontrano la ragazza di Peter, Jessica (o Niki), che dice loro che Peter non è interessato e li manda da Mr. Bennet, in Texas. Matt sta interrogando Hiro, dicendogli che in passato ha ucciso molte persone, ma Hiro non ricorda nulla di tutto ciò. Matt poi riceve una telefonata dal presidente, Nathan, che gli dice di scoprire tutta la verità. Nathan poi chiama Mohinder, e gli chiede se sono riusciti a trovare una soluzione per ristabilire le condizioni di quelli che non sono dalla loro parte, e Mohinder dice che ci sono molto vicini, ma che è una cosa complicata, in quanto è tutto radicato nel loro DNA ed è come se fossero di una specie diversa. Nathan gli dice che queste persone sono sotto incontrollabili e che l'unica soluzione sarebbe l'estinzione. L'Hiro del futuro e Ando arrivano da Mr. Bennet e chiedono il suo aiuto. Mentre stanno parlando però arriva Matt che tramortisce Hiro e blocca Ando; Peter però li raggiunge, e utilizzando i suoi poteri, prima ferma il tempo e poi si teletrasporta portando con sé Hiro e Ando. Mr Bennet raggiunge Claire in un locale, che però ha cambiato identità per non essere riconosciuta; le dice che qualcuno sa di lei e che se ne deve andare il prima possibile. Quando poi torna da Matt, quest'ultimo lo minaccia con una pistola, chiedendogli di dirgli dove si trova Claire, ma lui non vuole rivelarlo e Matt spara. Matt poi riesce a rintracciare Claire e a raggiungerla. Mohinder spiega a Nathan che Hiro sta cercando di tornare indietro nel tempo per riuscire ad uccidere Sylar, ma Nathan non è d'accordo e gli dice che andrà ad annunciare che ha trovato una cura per ristabilire il codice genetico (anche se è una bugia), e gli chiede di essere dalla sua parte, e Mohinder annuisce. Vengono poi raggiunti da Matt che dice loro che esistono due Hiro e che hanno preso quello più giovane. A casa Petrelli Claire e Nathan si incontrano; Claire lo colpevolizza dicendo di aver fatto in modo che tutti avessero paura di loro, ma lui le risponde che ha fatto solo in modo che tutti sapessero di loro, e che la paura è solo una conseguenza naturale. Ma in realtà non è Nathan, è Sylar, che evidentemente ha assorbito i poteri di Candice, e che ora vuole prendere il potere di Claire. Peter e Niki stanno discutendo.. Peter le dice di dimenticare tutto, di dimenticare Jessica, DL e Micah che non ci sono più... Peter le dice che deve andare via e le confessa che in realtà è stato lui a far esplodere New York, e Nathan ha mentito solo per proteggerlo. Peter deve andare da Hiro ed aiutarlo a cambiare il futuro. Mentre Nathan fa il suo discorso alla nazione, Peter, l'Hiro del futuro e Ando si preparano al combattimento. Mohinder sta preparando la sostanza da iniettare ad Hiro, ma alla fine colpisce l'haitiano, impedendogli di bloccare i poteri degli altri. Gli altri riescono quindi a raggiungere Hiro e L'Hiro del futuro gli dice che porterà lui e Ando nel passato, nel momento esatto in cui dovranno agire, ma prima di farlo viene colpito da Matt. Matt telefona a Nathan informandolo della morte dell'haitiano e lui improvvisamente spicca in volo e raggiunge Peter, rivelandosi poi Sylar. Mentre Sylar e Peter combattono Hiro e Ando tornano indietro nel tempo...