CITAZIONE
L'episodio inizia con Claire Bennet e Peter Petrelli quattro anni avanti nel futuro, Claire, non si sa per quale motivo, vuole sparare a Peter, ma quando il colpo esplode Peter blocca il tempo, schiva il proiettile, ruba l'arma e torna quattro anni indietro nel passato. Qui si rivela essere l'uomo che alla fine della seconda serie sparò a suo fratello Nathan. Peter del presente insegue il se stesso del futuro, che lo imprigiona nel corpo di Jesse Murphy, un detenuto dalla Compagnia nel famoso Livello 5. Il Peter del futuro fingendosi il sé stesso del passato, torna a recuperare la pistola nascosta dopo l'attentato, ma viene scopeèrto da Matt Parkman. Per questo Peter é costretto a teletrasportarlo (senza avere la necessità di farlo a sua volta) in un deserto, che si scoprirà successivamente essere in Africa. Peter quindi va a verificare le condizioni di Nathan, il quale si rianima all'improvviso nonostante sia stato dichiarato morto. Decide però di risparmiarlo, accorgendosi che l'esperienza della morte ha generato in suo fratello un'istintiva fede in Dio, ma soprattutto perché Nathan non ha più intenzione di rivelare la verità al mondo dato che crede che questo ostacolerebbe la sua missione "divina".
Hiro Nakamura si trova nel suo ufficio con Ando Masahashi quando gli viene recapitato dall'avvocato di famiglia un DVD, registrato dal padre con la disposizione di essere consegnato solo dopo la sua morte; nel disco Kaito Nakamura affida al figlio il compito di controllare la sua cassaforte e gli raccomanda di non aprirla mai. Però la curiosità prende il sopravvento su Hiro che la apre. Al suo interno trova un altro messaggio del padre. Kaito aveva previsto la curiosità del figlio, tanto che aveva già registrato sul dvd il suo rimprovero per aver aperto la cassaforte, che contiene la metà di una formula che non deve assolutamente cadere nelle mani sbagliate. Mentre Hiro e Ando soppesano la gravità del loro compito, irrompe una ragazza dotata di supervelocità (Daphne Millbrook) che trafuga la formula; Hiro blocca il tempo per raggiungerla, ma questa reagisce e lo stordisce scappando via. (Sembra che il potere di Hiro non sia in grado di bloccare la ragazza completamente.) Hiro va quindi avanti nel tempo per vedere cosa potrebbe accadere dopo aver perso la formula, ma trova una città nel caos, vede Ando uccidere la sua versione futura con una scarica di fulmini rossi emessi dal palmo delle mani.
Intanto Claire, appreso dell'attentato al padre biologico, chiama Peter (ma non sa si tratti del Peter del futuro) che le intima di non muoversi di casa. Poco dopo irrompe Sylar per rubarle i poteri, che riesce quindi ad acquisire così il potere di rigenerazione spontanea. Oltre a questo, Sylar ruba tutti i rapporti riguardanti i detenuti speciali tenuti prigionieri dalla Compagnia nel Settore 5, con l'ovvia intenzione di prendere tutti i loro poteri, dato che non è ancora riuscito a recuperare completamente i suoi. Nemmeno l'asportazione della calotta cranica uccide Claire, che chiede a Sylar perché le abbia risparmiato la vita. Le risponde: «Povera ragazza, il tuo cervello non è come quello di tutti gli altri, tu sei speciale, io non potrei ucciderti neanche se lo volessi: tu non morirai mai e da adesso forse neppure io». In seguito all'attacco di Sylar, Noah manda Meredith Gordon, la madre biologica di Claire, a casa per proteggere la sua famiglia.
Il professor Mohinder Suresh studia il potere di Maya Herrera e riesce a capire, dagli ormoni (piu precisamente dall'adrenalina) di quest'ultima, come far sviluppare i poteri in tutte le persone. Maya lo supplica di disfarsi del siero ottenuto per paura che altre persone possano avere poteri terribili come il suo e quello di Sylar, ma, dopo qualche dubbio, Mohinder decide di iniettarselo e acquista così quella che pare essere superforza.